Проте сучасні мікрохвильові печі влаштовані так, що хвилі не виходять за межі приладу, якщо він не пошкоджений.
Багато хто помічав металеву сіточку на дверцятах мікрохвильової печі. Вона виконує захисну функцію, не пропускаючи мікрохвильове випромінювання назовні. Тому, якщо прилад справний, він безпечний для користувачів.
Щодо впливу на їжу, мікрохвильова піч не спричиняє в ній утворення небезпечних речовин. Важливо розуміти, що процес приготування в ній відрізняється від приготування на сковорідці або в духовці. Наприклад, у духовці відбувається так звана реакція Майяра, яка сприяє утворенню аромату смаженого м’яса, кави, хліба. У мікрохвильовій печі ж їжа фактично париться, не досягаючи настільки високих температур, тому смакові властивості можуть відрізнятися.

Проте це має і позитивний бік: у мікрохвильовці не утворюються шкідливі речовини, які можуть з’являтися під час смаження. Таким чином, вибір між смаком і користю залишається за кожним.
Ще один нюанс – нерівномірний розігрів продуктів. У духовці нагрів відбувається від зовнішнього шару до центру, а в мікрохвильовій печі – навпаки: спочатку нагрівається середина. Це може бути проблемою, оскільки небезпечні мікроорганізми найчастіше перебувають на поверхні їжі. Тому важливо використовувати спеціальний посуд або рукав для запікання, щоб тепло рівномірно розподілялося.
Як і будь-яка термічна обробка, мікрохвильове приготування знижує вміст вітамінів та інших біологічно активних речовин. Проте це не є чимось унікальним – так само відбувається і при традиційних способах готування.